发生工程事故的处理如下：采取必要的防护措施，防止事故进一步扩大；总监理工程师以《工程事故通知单》的形式通知施工单位，要求停工；施工单位进行事故调查，填写调查报告报监理单位与工程部；组织事故原因分析会，追究相关责任人的责任；提出事故处理方案，填写《工程事故处理报告》。
【法律依据】
《建筑法》第六十一条
交付竣工验收的建筑工程，必须符合规定的建筑工程质量标准，有完整的工程技术经济资料和经签署的工程保修书，并具备国家规定的其他竣工条件。建筑工程竣工经验收合格后，方可交付使用；未经验收或者验收不合格的，不得交付使用。
